Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psen1P49769 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms