Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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