Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wnt11P48615 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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