Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg3P47867 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg3P47867 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms