Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc2P43407 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdc2P43407 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms