Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NodalP43021 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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