Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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