Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik2P39087 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms