Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtlP38585 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtlP38585 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtlP38585 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms