Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6fP35460 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms