Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms