Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rom1P32958 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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