Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms