Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms