Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjc1P28229 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms