Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms