Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrafP28028 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BrafP28028 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrafP28028 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrafP28028 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms