Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo2P25801 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms