Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms