Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms