Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cst3P21460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cst3P21460 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cst3P21460 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cst3P21460 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cst3P21460 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cst3P21460 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cst3P21460 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cst3P21460 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cst3P21460 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cst3P21460 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cst3P21460 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms