Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp4P21275 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bmp4P21275 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms