Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ntf3P20181 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms