Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms