Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18530 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18530 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18530 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18530 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18530 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18530 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18530 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms