Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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