Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmga1P17095 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms