Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptbP15508 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptbP15508 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptbP15508 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptbP15508 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms