Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prph2P15499 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms