Protein–RNA interactions for Protein: P14429

H2-Q7, H-2 class I histocompatibility antigen, Q7 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q7P14429 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Q7P14429 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q7P14429 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms