Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms