Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms