Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatspereP0DP43 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms