Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Amd1P0DMN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms