Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LtaP09225 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtaP09225 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtaP09225 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtaP09225 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtaP09225 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtaP09225 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms