Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb6P09023 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms