Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApoeP08226 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApoeP08226 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms