Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtrP07309 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtrP07309 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TtrP07309 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TtrP07309 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TtrP07309 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtrP07309 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtrP07309 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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TtrP07309 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtrP07309 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms