Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms