Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9P06683 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9P06683 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9P06683 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9P06683 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms