Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JunP05627 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JunP05627 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JunP05627 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JunP05627 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JunP05627 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms