Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01657 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01657 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01657 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01657 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01657 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01657 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms