Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casp8O89110 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casp8O89110 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms