Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tom1O88746 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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