Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms