Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms