Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CaskO70589 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CaskO70589 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CaskO70589 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms