Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Foxq1O70220 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Foxq1O70220 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxq1O70220 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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