Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap2O55126 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms