Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms